La diagnosi e la stadiazione della malattia sono i due obiettivi primari per un corretto trattamento.
La diagnosi certa è solamente istologica (parte operatoria) ma spesso esistono dei sintomi specifici e dei reperti obiettivi fortemente suggestivi per endometriosi che devono essere attentamente valutati. Innanzitutto visita seguita da ecografia e markers, in particolare Ca 125 e CA19.9, sono elementi utili ai fini diagnostici.